Alerte rouge (condition rouge ou code rouge) est le plus haut niveau de signal d'alerte sur les vaisseaux de Starfleet (un niveau de plus que l'alerte jaune).

Le capitaine ou les personnes habilitées donnent l'ordre de passer en alerte rouge en cas de situation de combat ou de danger. L'alerte rouge peut également être activé automatiquement dans certaines situations.

L'alerte rouge est alors annoncée par des panneaux d'affichage clignotants et par des sirènes afin d'avertir au plus vite le personnel de la situation en cours, pour qu'ils regagnent leurs postes.

Le statut d'alerte rouge active automatiquement les armements et boucliers du vaisseau. D'autres systèmes deviennent également automatiquement pleinement fonctionnels ou en attente.

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Avant le 22ème siècle, ce protocole n'existait pas. En 2152, Malcolm Reed développe une condition d'alerte tactique à bord de l'Enterprise (NX-01), afin de réagir plus rapidement aux situations dangereuses. Le nom de "Reed Alert" fut d'ailleurs envisagé. (ENT: "Singularity"). Au 23ème siècle, le système fut remplacé par les conditions d'alerte rouge et d'alerte jaune.

Il semblerait que plusieurs niveaux d'alerte rouge existent : double alerte rouge (TOS: "The Conscience of the King"), alerte rouge maximale (VOY: "Scorpion, Part II")